据了解，早前方舟子发表过《清华大学医学院院长助理刘辉教授如此伪造论文发表记录》一文，指出署名为“LiuH”的论文作者并不是刘辉，而是另一位学者，同时还就刘辉简历中的“1999-2004美国纽约大学医学院外科研究中心主任”提出质疑。刘辉也在接受媒体采访时表示，论文并不是他的，但认为是图书馆在检索时出了问题，因两人英文名字缩写完全一样，所以误将该论文收入他的名下。

　　清华大学新闻中心这位负责人还进一步证实，以上决定是在3月10日的2005—2006学年度第12次校务会通过的，“当时是根据学校在学术方面的相关规定处理的”。

　　记者了解到，这位负责人口中的“规定”，指的正是《清华大学教职工处分暂行规定》和《清华大学关于学术不端行为的处理办法（试行）》。校务会正是依据这些，认定刘辉的行为“属学术不端”，做出“撤销了清华大学教授职务，并解除了与他的聘任合同”的决定。